Die Varianzanalyse (ANOVA) wird verwendet, um die Varianz einer abhängigen Variablen zu untersuchen. Die abhängige Variable wird auf verschiedenen Stufen einer oder mehrerer Faktorvariablen gemessen. Die Gesamtvarianz wird mit dem Ziel, die Faktoreffekte zu quantifizieren, in faktorbezogene Komponenten und in Messfehler aufgeteilt.
Origin bietet die einfache und die zweifache ANOVA. OriginPro verfügt zusätzlich über die einfache und die zweifache ANOVA mit wiederholten Messungen.